#本文由馬爾文帕納科醫(yī)藥業(yè)務(wù)發(fā)展經(jīng)理 韓佩韋博士供稿#
蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性研究對(duì)于加深對(duì)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能的了解有著非常重要的意義。差示掃描量熱技術(shù)(DSC)是直接測(cè)量熱轉(zhuǎn)變過(guò)程焓變(ΔH)的分析方法,例如蛋白質(zhì),核酸或其他生物多聚物的熱變性過(guò)程,為表征蛋白質(zhì)及其他生物分子的熱穩(wěn)定性建立“金標(biāo)準(zhǔn)"技術(shù)。
一、焓變對(duì)于蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性意味著什么?
1,什么是焓(hán)變(ΔH)?
ΔH(焓變)是在恒壓狀態(tài)下將系統(tǒng)升高至溫度T過(guò)程中攝取的總能量。對(duì)于蛋白質(zhì)而言,這意味著用于使蛋白質(zhì)發(fā)生去折疊所花費(fèi)的能量(熱量),此過(guò)程中 ΔH 是為正值,代表這是一個(gè)吸熱過(guò)程。這種能量與蛋白質(zhì)中所有原子和分子運(yùn)動(dòng)相關(guān),以及維系蛋白質(zhì)保持折疊構(gòu)象中的鍵能。
通過(guò)將吸熱譜圖下方的面積進(jìn)行積分(見(jiàn)圖 1)可以計(jì)算得到焓變(ΔH)。焓變用每摩爾蛋白質(zhì)的吸收的卡路里(或焦耳)來(lái)表示。由于蛋白質(zhì)在 DSC 實(shí)驗(yàn)中暴露于升高的溫度,因此蛋白質(zhì)開(kāi)始發(fā)生熱變性,并伴隨著非共價(jià)鍵的斷裂。焓變(ΔH)與維系蛋白質(zhì)天然(折疊)構(gòu)象中所需的價(jià)鍵數(shù)量有關(guān)。焓變(ΔH)也取決于我們測(cè)量總蛋白質(zhì)濃度的準(zhǔn)確程度。如果蛋白質(zhì)濃度不是很準(zhǔn)確, 則會(huì)影響到計(jì)算出的ΔH值。
2,焓變(ΔH)值可以在實(shí)踐中告訴我們什么?
當(dāng)您比較不同蛋白質(zhì)的DSC結(jié)果時(shí),具有較大ΔH值的蛋白質(zhì)不一定比具有較小ΔH的蛋白質(zhì)更穩(wěn)定。由于ΔH值會(huì)對(duì)蛋白質(zhì)摩爾濃度歸一化,因此該值通常與蛋白質(zhì)的尺寸成比例。大多數(shù)蛋白質(zhì)具有相同的鍵密度(單位體積內(nèi)的價(jià)鍵數(shù)量),因此,期待具有較大分子量的蛋白質(zhì)也具有較大的焓變(ΔH)值也是合理的。
3,焓變(ΔH)的決定因素是什么?
焓變(ΔH)取決于溶液中天然蛋白質(zhì)的百分比。
一個(gè)非常重要的考慮是DSC僅測(cè)量初始處于折疊(天然)構(gòu)象中的蛋白質(zhì)的ΔH值。ΔH值取決于具有折疊(活性)構(gòu)象的濃度。如果初始折疊蛋白質(zhì)組分小于總蛋白質(zhì)濃度(即活性濃度小于100%),則計(jì)算出的ΔH值將相應(yīng)地變小。
下圖顯示了在儲(chǔ)存期間的不同時(shí)間測(cè)量的相同蛋白質(zhì)的DSC圖譜。藍(lán)色曲線圖譜表示新鮮制備的蛋白質(zhì),是100%天然(折疊)蛋白質(zhì)。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)樣品在儲(chǔ)存期間發(fā)生部分變性時(shí),溶液中的天然蛋白質(zhì)的比例開(kāi)始下降,導(dǎo)致DSC圖譜的焓變降低。當(dāng)我們擁有100%天然蛋白質(zhì)的參考DSC圖譜時(shí),我們可以根據(jù)不同狀態(tài)樣品的相對(duì)ΔH值來(lái)估計(jì)每個(gè)樣品中的折疊蛋白質(zhì)比例。
4,如何判斷蛋白質(zhì)是否失活?
到目前為止,我們已提及的焓變是指通過(guò)DSC儀器直接測(cè)量到的“熱"焓,也就是熱力學(xué)焓變,通常表示為ΔHcal,這是其他任何非量熱技術(shù),例如圓二色譜(CD),表面等離子共振(SPR)等技術(shù)不能獲取的焓變量。
還有另一種其他技術(shù)可以獲取的焓變類(lèi)型,即范霍夫焓變 - ΔHVH,我們同樣可以通過(guò)DSC數(shù)據(jù)計(jì)算得出。范霍夫焓變(ΔHVH)可從通過(guò)DSC非兩狀態(tài)模型(non-2-state model)擬合得到。
兩種不同的焓變對(duì)蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性的測(cè)定又有什么實(shí)際意義呢?
在DSC技術(shù)中,ΔHcal僅由DSC熱轉(zhuǎn)變峰曲線積分的面積來(lái)確定,而ΔHVH僅通過(guò)熱轉(zhuǎn)變峰曲線的形狀來(lái)確定。轉(zhuǎn)變峰形越尖銳,ΔHVH越大,反之亦然。ΔHcal是具有濃度依賴性的,但ΔHVH不是。
若ΔHcal/ΔHVH比例為1,通常意味著所研究的熱轉(zhuǎn)變狀態(tài)符合兩狀態(tài)去折疊(Two-state unfolding model)模型。如果ΔHcal/ΔHVH比例大于1,則意味著存在顯著密集的中間體存在; 而ΔHcal/ΔHVH比小于1,則意味著存在分子間相互作用。
使用ΔHcal/ΔHVH可以幫我們估測(cè)是否有很大部分蛋白質(zhì)是失活的。如果我們有一個(gè)簡(jiǎn)單的單結(jié)構(gòu)域蛋白質(zhì),并且假定沒(méi)有中間體,則我們可以預(yù)測(cè),其去折疊過(guò)程的ΔHcal/ΔHVH的比值不會(huì)遠(yuǎn)離1。因此,如果ΔHcal顯著低于ΔHVH,可以表明很大部分蛋白質(zhì)已經(jīng)失活。
綜上所述,對(duì)DSC中ΔH數(shù)據(jù)的分析可以讓我們了解蛋白質(zhì)的去折疊機(jī)制,以及多少蛋白質(zhì)處于其活性的天然構(gòu)象。
二、TM值如何與和蛋白質(zhì)穩(wěn)定性相關(guān)?
中點(diǎn)轉(zhuǎn)變溫度TM
我們可以從DSC數(shù)據(jù)中提取多個(gè)熱力學(xué)參數(shù),例如ΔH,ΔHVH(范霍夫焓變),ΔCP和ΔG,但*泛使用的參數(shù)是TM。順便提一下,這也是最容易和最準(zhǔn)確的值 - TM是最大峰值所對(duì)應(yīng)的溫度。
“蛋白質(zhì)穩(wěn)定性"有多種定義。最常見(jiàn)的是,對(duì)于工業(yè)上有重要意義的蛋白質(zhì),該術(shù)語(yǔ)是指在生理溫度下的功能(或操作)穩(wěn)定性; 即,他們可以在37°C下發(fā)揮多長(zhǎng)時(shí)間的生物功能?這可以通過(guò)需要花幾天或數(shù)周時(shí)間的等溫研究來(lái)評(píng)估,或者,如果使用差示掃描量熱法(DSC),則可以在幾分鐘內(nèi)變性蛋白質(zhì)。
通過(guò)DSC獲得的哪個(gè)熱力學(xué)參數(shù)與功能穩(wěn)定性相關(guān)度最佳?事實(shí)證明,是TM值。
熱力學(xué)穩(wěn)定性(ΔG)是功能穩(wěn)定性的較差的預(yù)測(cè)因子; 技術(shù)上,ΔG僅適用于可逆去折疊過(guò)程,此外,它由TM,ΔH和ΔCP計(jì)算得到,后者可能很難獲取。
一個(gè)例子是TM和ΔG與肉桿菌蛋白抗原血清型C的半數(shù)聚集時(shí)間(half time)(作為功能穩(wěn)定性的量度)的相關(guān)性,用作模型蛋白。ΔG與T1 / 2 agg. 相關(guān)系數(shù)(R)僅為0.4,而TM 與 T1 / 2 agg.的相關(guān)系數(shù)是0.92。(來(lái)自J Pharm Sci的數(shù)據(jù),2011 Mar; 100(3):836-48)
思考TM的一種方式:
如下圖所示,假設(shè)我們用 DSC 掃描兩種不同配方中的蛋白質(zhì)或兩種不同的蛋白質(zhì)構(gòu)建體,則 TM 值向低溫方向 5℃ 的負(fù)偏移(穩(wěn)定性下降)實(shí)際上反映了在 37℃ 條件下的 Fu (蛋白去折疊比例)由2%增加到 3%。溫度 T 下的 Fu 蛋白可以通過(guò)圖像化的方式估算,即溫度 T 以下的曲線下陰影區(qū)域面積和整個(gè)曲線下方面積的百分比。
由于聚集體的生成可能是濃度依賴的過(guò)程,因此較高濃度的去折疊蛋白質(zhì)(紅色掃描曲線)將導(dǎo)致較快的聚合(更大組分的去折疊狀態(tài)(U)才能轉(zhuǎn)換為不可逆變性狀態(tài)(I)。參見(jiàn)下面的原理圖。
這種解析的一個(gè)推論是,曲線的整體形狀應(yīng)該是相似的。我們假定這種情況是對(duì)于在不同配方中的相同蛋白質(zhì)或由一個(gè)母分子衍生出來(lái)的具有相似構(gòu)建體的蛋白質(zhì)。但是,對(duì)于*不同的蛋白質(zhì),使用TM值作為用于穩(wěn)定性比較的預(yù)測(cè)指標(biāo)則應(yīng)該謹(jǐn)慎使用。
擴(kuò)展閱讀
Differential Scanning Calorimetry (DSC): Theory andpractice
Differential Scanning Calorimetry (DSC) forBiopharmaceutical Development: Versatility and Power
The Power of Heat: Digging Deeper with DifferentialScanning Calorimetry to Study Key Protein Characteristics
PEAQ-DSC 微量熱差示掃描量熱儀:DSC
差式掃描量熱法(DSC)是一種直接分析天然蛋白質(zhì)或其他生物分子熱穩(wěn)定性的技術(shù),無(wú)需外在熒光素或者內(nèi)源熒光,它通過(guò)測(cè)定在恒定的升溫速率下使生物分子發(fā)生熱變性過(guò)程中的熱容變化來(lái)實(shí)現(xiàn)。
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關(guān)于馬爾文帕納科
馬爾文帕納科的使命是通過(guò)對(duì)材料進(jìn)行化學(xué)、物性和結(jié)構(gòu)分析,打造出客戶導(dǎo)向型創(chuàng)新解決方案和服務(wù),從而提高效率和產(chǎn)生可觀的經(jīng)濟(jì)效益。通過(guò)利用包括人工智能在內(nèi)的最近技術(shù)發(fā)展,我們能夠逐步實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)。這將讓各個(gè)行業(yè)和組織的科學(xué)家和工程師可解決一系列難題,如提高生產(chǎn)率、開(kāi)發(fā)更高質(zhì)量的產(chǎn)品,并縮短產(chǎn)品上市時(shí)間。